5月20日，市农科院茶叶所李瑾博士团队在期刊Genetic Resources and Crop Evolution（IF=2.0）发表论文《城步峒茶叶绿体基因组和比较基因组分析：突变热点和系统发育关系》，这是以市农科院为第一完成单位的首篇SCI论文，文章揭示了城步峒茶叶绿体全基因组序列与结构，为其遗传背景的研究和系统进化关系的探索奠定了基础。

相关介绍

城步峒茶是湖南省四大地方优良茶树群体种之一，属南方大叶种乔木型茶树，是由茶树原产地演变而来的南方型茶树，为中国特有的珍稀茶树资源。

城步峒茶茶树资源照片（左边是青叶峒，右边是黄叶峒）

市农科院始终立足邵阳资源禀赋，聚焦“七大工程”重大关键技术攻关，开展茶树本地适应性基础研究，为茶树分子育种提供遗传基础，着力打造茶叶种质资源试验基地，培育筛选优良品系，进一步加快种业振兴行动，切实推动茶产业高质量发展，助力邵茶复兴。

主要结果

本研究利用Illumina NovaSeq 6000对城步峒茶进行DNA测序，利用SPAdes v3.10.1软件对其叶绿体基因组进行组装，并对其特征和系统发育定位进行分析。结果表明，城步峒茶叶绿体基因组总长度为157025 bp，包含一个大的单拷贝区(LSC, 86586 bp)、一个小的单拷贝区(SSC, 18277 bp)和两个反向重复区(IR, 26081 bp)。

城步峒茶叶绿体基因组圈图

作者鉴定出变异最大的6个基因区间(psbI-atpA, rsp4-ndhJ, ycf4-cemA, psbH-petB, ycf15-ndhB, and ndhF-rpl32)和3个基因(rps19, rps15, and ycf1)。

城步峒茶叶绿体基因组突变热点信息图

系统发育分析表明，城步峒茶 (C. duntsa) 与安化云台山种 (C. anhua) 、福鼎大白 (C. fudingdabaicha) 和毛叶茶 (C.ptilophylla) 亲缘关系密切。这些发现可为进一步研究茶树育种、茶树系统发育及茶树进化提供重要的遗传信息。

期刊介绍

《遗传资源与作物进化》涵盖植物遗传资源研究的方方面面，收录了有关遗传资源的分类学、形态学、生理学、生物化学、遗传学、细胞学或民族植物学研究方面的原创文章，还包括基因库管理方面的文章：收集、维护、评估、储存和记录。

DOI（原文链接）: https://doi.org/10.1007/s10722-024-02002-6